Система CS PoliBase имеет встроенный модуль учета рабочего времени сотрудников.

Регистрация и учет рабочего времени может осуществляться с помощью сканера отпечатков пальцев (биометрический способ) и без помощи сканера отпечатков пальцев (традиционный способ). В отличие от других систем учета и контроля рабочего времени биометрический способ исключает ошибки и обман со стороны сотрудников при регистрации в журнале приходов и уходов.

Система учета и контроля рабочего времени связана с расписанием работы сотрудников и журналом табельного учета, что позволяет отслеживать опоздания и внеурочные часы работы, а также рассчитывать повременную часть заработной платы по объективным фактическим данным.

Кроме регистрации времени прихода сотрудников на работу и ухода с работы система может вести учет фактического времени каждого приема пациента (рабочего времени специалиста, затраченного на каждого пациента). Этот учет выполняется в процессе регистрации приема пациента.